1、采收：蘑菇、香菇之類的食用菌，供食用主要部位是菌蓋，而金針菇卻以菌柄為主，所以菌柄又長又嫩如黃花萊般的金針菇則為上品。采收時不宜大早或過遲，太早采收，產量低：過遲采收，質量差，因此要掌握適時采收。一般要求菌蓋邊緣剛離開菌帆開傘度3分左右，茵蓋直徑1~３厘米，菌柄長度13~15厘米時即可進行采收。采收時，一手抓住菌袋，一手伸人袋內，輕輕地抓住菇叢拔下，菇腳帶木屑處要用小刀整齊地切去，殘留在培養基上的菇腳要清除干凈，表面再輕輕地扒一層，促使下一批現蕾。

2、加工：金針菇的加工以制作罐頭為主，目前，我國福建省泉州罐頭廠等單位已將金針菇制成金菇罐頭，深受人們喜愛。此外也可采用曬干、烤干等方法，制成于品貯藏。